Чтобы установить DokuWiki используя дерево портов во FreeBSD, сделайте следущее:

#> cd /usr/ports/www/dokuwiki
#> make install clean

Директория DokuWiki по умолчанию /usr/local/www/dokuwiki. Конечно, директория может быть изменена или привязана символической ссылкой куда угодно

Чтобы сконфигурировать dokuwiki скопируйте из файла /usr/local/www/dokuwiki/conf/dokuwiki.php опции, которые вы хотите отредактировать, в файл /usr/local/www/dokuwiki/conf/local.php.

Это нужно сделать обязательно, потому что утилита portupgrade перезапишет файл dokuwiki.php.

Обновление через дерево портов:

#> portupgrade dokuwiki

Перед этим убедитесь, что само дерево портов было обновлено, иначе это не даст никакого эффекта.