每天DokuWiki会检查一次是否有更新。此更新系统会提醒Dokuwiki系统管理员关于新版本或安全性警告相关讯息。

若有启动权限管理（ACL）机制，更新讯息仅会知会给Superuser层级的人知道。如果没有启动权全管理，则所有的使用者都会看到讯息。

更新细项请参考update.dokuwiki.org（请注意防火墙设定是否可允许连上）。若您不愿意使用此功能，可以到config manager将项目updatecheck关闭。

每一则讯息都有自己的独立编号（以方括号括起）。当编号高于conf/msg所设定的号码，该讯息才会被显示。若您更新了该讯息所宣达的版本，conf/msg档也同时会更新，之后该讯息就不会再被显示出来了。如果你不想更新该版本又不希望再看到更新讯息，简单的作法就是直接修改conf/msg的数字。

系统更新之后，同样的更新讯息可能仍然会被显示（即使conf/msg号码已在更新过程中被升级）。这是因为Dokuwiki的快取每日仅更新一次。通常等待一天过后即可正常显示，或是touch¹⁾conf/msg档或删除data/cache/messages.txt快取档。